Objetivo: Estudo retrospectivo das principais causas de patologias isoladas que acometem o seio esfenoidal com discussão dos métodos mais apropriados de diagnóstico e tratamento. Material e métodos: Um total de 45 casos de patologia esfenoidal isolada atendidos entre janeiro de 2008 a outubro de 2011 foram avaliados por exame otorrinolaringológico objetivo e vídeo-endoscopia nasossinusal, tomografia computadorizada de seios paranasais e em alguns casos ressonância nuclear magnética quando necessário. Em cada caso, foi selecionado entre o tratamento medicamentoso e/ou cirúrgico endoscópico. Resultados: Foram identificados 11 casos de esfenoidite isolada (24,4%), 3 casos de esfenoidite fúngica (6,6%), 3 casos de pólipo esfenocoanal (6,6%), 23 casos de mucocele (51,1%), 1 de meningoencefalocele (2,2%), 2 casos de fístula liquórica (4,4%), 1 de papiloma invertido (2,2%) e 1 caso de carcinoma epidermóide (2,2%). Conclusão: Encontrou-se prevalência de doenças inflamatórias e infecciosas sendo que a cirurgia endoscópica para abordagem do seio esfenoidal é efetiva no tratamento da várias patologias isoladas do esfenóide complicadas ou não.