Objetivo: Analisar os limiares obtidos na testagem dos potenciais evocados auditivos de tronco encefálico (PEATE) por via aérea e via óssea em crianças, menores de 15 meses, com agenesia de conduto auditivo externo. Material e Método: Foram avaliadas 22 crianças, 7 meninas e 15 meninos, com idade entre 2 e 12 meses de idade com agenesia do conduto auditivo externo. Realizamos a pesquisa dos potenciais evocados auditivos de tronco encefálico por via aérea e via óssea, nas freqüências de 500Hz e 2000Hz. Equipamento utilizado Smart EP, da marca IHS. Resultados: Os limiares eletrofisiológicos obtidos por condução óssea, em todas crianças apresentaram valores dentro da normalidade, demonstrando a integridade da orelha interna. Na pesquisa da via aérea, os valores dos limiares apresentaram alteração, houve aumento das latências absolutas em todas orelhas pesquisadas e não houve aumento das latências interpicos. A análise dos PEATE por via aérea em conjunto com a via óssea, aumentam a possibilidade de um diagnóstico mais preciso e precoce. Conclusão: Verificamos que a perda auditiva condutiva não influencia nos limiares eletrofisiológicos obtidos por condução óssea por meio dos PEATE. A pesquisa dos PEATE por via óssea é uma ferramenta importante para avaliar a integridade coclear em crianças com agenesia de conduto auditivo, menores de 12 meses de idade.